martedì 21 gennaio 2014

lcnRNA: LONG NON-CODING RNA



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Esistono RNA non codificanti? A cosa servono? Quanti tipi se ne conoscono?

long non coding RNA
lncRNA è acronimo di long non coding RNA. I lncRNA, come i microRNA, i siRNA, gli aRNA, i piwiRNA ed altri, fanno parte del gruppo degli RNA non codificanti (ncRNA), la cui crucialità in vari processi biologici è ormai data per scontata, anche se in molti casi i meccanismi di azione rimangono oscuri.

Per un discorso più generale sui vari tipi di RNA non codificanti potete leggere RNA NON CODIFICANTI (ncRNA): I PILOTI DELLA CELLULA.

È ormai dimostrato che non soltanto i geni che codificano per proteine (che rappresentano solo l'1% di tutto il genoma) vengono trascritti in RNA. Sembra che anche la maggior parte del genoma non codificante venga trascritto in RNA per l'appunto non codificante. Si definisce lncRNA una molecola di RNA non codificante di lunghezza superiore a 200 paia di basi (>200 bp).

Aria bollente!

Fu grazie ad uno studio di Rinn et al (2007) che si intuì per a prima volta l'importanza dei lncRNA. Rinn descrisse una molecola, che chiamò HOTAIR, la cui funzione era quella di regolare l'espressione genica. HOTAIR poteva agire sia in cis che in trans. Fu grazie alla descrizione di HOTAIR che si capì che potevano esistere RNA diversi sia dai tradizionali RNA housekeeper (snRNA, tRNA, rRNA), sia dai già noti microRNA e RNA coinvolti nella regolazione dei processi di imprinting. HOTAIR è catalogato in OMIM alla entry 611400. Altri esempi di lncRNA identificati nell'uomo: DBE-T, HOTTIP, ANRIL, TINCR, 1/2sbsRNA1.

Quale funzione svolgono i lncRNA?

I lncRNA, come molti altri tipi di ncRNA, agiscono da regolatori dell'espressione genica. Questo compito può essere svolto attraverso l'interazione con le proteine istoniche o attraverso il legame con sequenze di DNA complementari e forse anche in modo autonomo all'interno del nucleo, senza cioè che il lncRNA si leghi ad alcun partner molecolare specifico.

Per saperne di più: Identification and function of long non-coding RNA (PubMed).

Libri e Pubblicazioni su lncRNA


Identification and function of long non-coding RNAIdentification

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